Formation permanente Modélisation Moléculaire 20-22 et 27-29 Septembre 2004

Formation permanente INSERM « Modélisation Moléculaire »

20-22 et 27-29 Septembre 2004

Animateurs: C. Etchebest, P. Tufféry (INSERM E 0346)

Lieu: RPBS, tour 53-54 1er etage,
Université Paris 7, case 7113
2 place Jussieu
75251 Paris cedex 05 (Métro Jussieu)

Lundi 20:

    9h15- 9h30: Accueil (C. Etchebest et P. Tufféry)
    9h30-11h00: Rappels Linux (P. Tufféry)
    11h00-12h30: Introduction Modélisation Moléculaire (C. Etchebest)

    14h-14h20: Introduction au format PDB (P. Tufféry)
    14h20-15h00: TP PDB (P. Tufféry)
    15h00-17h00: Visualisation 3D (P. Tufféry)

Mardi 21:

    9h30-10h30: Analyse de la structure des protéines (C. Etchebest)
    10h30-12h30: TP Analyse de la structure des protéines (C. Etchebest)

    14h00-14h40: Alignement de séquences (C. Etchebest)
    14h40-15h30: TP Alignement de séquences (C. Etchebest)
    15h30-16h00: Alignement de structure (P. Tufféry)
    16h00-17h00: TP Alignement de structure, similitudes structurales (P. Tufféry)

Mercredi 22:

    9h30-10h30: Méthodes de prédiction de structure secondaire (C. Etchebest)
    10h30-11h00: Méthodes de prédiction de propriétés structurales (P. Tufféry)
    11h00-12h30: TP Prédiction (P. Tufféry)

    14h00-14h45: Chaînes latérales (analyse, positionnement) (P. Tufféry)
    14h45-17h00: TP Chaînes latérales (P. Tufféry)

Lundi 27:

    9h30-10h30: Modélisation comparative (C.Etchebest)
    10h30-12h30: TP Modélisation comparative (C.Etchebest, P. Tufféry)

    14h00-14h45: TP Modélisation comparative-suite (C.Etchebest, P. Tufféry)
    14h45-15h30: Validation de modèles (C. Etchebest)
    15h30-17h00: TP Validation de modèles (C. Etchebest, P. Tufféry)

Mardi 28:

    9h30-10h00: Modélisation de novo (P. Tufféry)
    10h00-12h00: TP Modélisation de novo (P. Tufféry)

    14h00-14h30: Méthodes spécifiques des protéines transmembrannaires (C. Etchebest)
    14h30-17h00: Modélisation d'une protéine transmembrannaire (C. Etchebest)

Mercredi 29:

    9h30-12h30: Problèmes spécifiques (C. Etchebest, P. Tufféry)

    14h00-15h30: Problèmes spécifiques (C. Etchebest, P. Tufféry)
    15h30-16h30: Evaluation, bilan, discussion