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 Some examples of protein coding in terms of Protein Blocks

• 1bzyA
• 1fp2A
• 7nn9

1bzyA

Human Hgprtase With Transition State Inhibitor

    1
(A) SPGVVISDDEPGYDLDLFCIPNHYAEDLERVFIPHGLIM
(B) ZZjaddfklnbjafklpccdfklmmmpcbdfbdfklmmm
(C) ccccccccccccccccccccccccccccccccccaaaaa
(D) CCCEECTTTTCCBCGGGCCCCGGGTTTEEEEEETHHHHH

    41
(A) RTERLARDVMKEMGGHHIVALCVLKGGYKFFADLLDYIK
(B) mmmmmmmmmmmmmmpccddddddfklmmmmmmmmmmmmm
(C) aaaaaaaaaaaacccbbbbbbbcccccaaaaaaaaaaaa
(D) HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEETTHHHHHHHHHHHHH

    81
(A) LNRNSDRSIPMTVDFIRLKSYCNDQSTGDIKVIGGDDLS
(B) mmmpfbdcddddddddddfbehjbcehiacdfbhklmmm
(C) aaaaacccccbbbbbbbbbbbbccccccccccccccccc
(D) HHHCCCCCCCEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEETTTGG

    121
(A) LTGKNVLIVEDIIDTGKTMQTLLSLVRQYNPKMVKVASL
(B) goiacddddfbdcelmmmmmmmmmmmmnopabdcdddfb
(C) cccbbbbbbbccccccaaaaaaaaaaaaccccbbbbbbc
(D) TTTTEEEEEEEEETTTHHHHHHHHHHHHCCTTEEEEEEE

    161
(A) VKRTPRSVGYKPDFVGFEIPDKFVVGYALDYNEYFRDLN
(B) cddfklnoiacfbdfbdcdfdddeeehiacehiaklgfb
(C) ccccccccccccccccbbbbccccccccccccccccccc
(D) EECTTTTCCCCTTEEEEEETTTCEEBTTBTBTTBTTTTC

    201
(A) VCVISETGKAKYKA
(B) cdddfklmmmmpZZ
(C) cbbbbaaaaaaacc
(D) EEEECHHHHHHHCC
	


	
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1fp2A

ISOFLAVONE O-METHYTRANSFERASE

    1
(A) RKPSEIFKAQALLYKHIYAFIDSMSLKWAVEMNIPNIIQ
(B) ZZfklmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnommmmmmm
(C) ccccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaaaacaaaaaa
(D) CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH

    41
(A) HGKPISLSNLVSILQVPSSKIGNVRRLMRYLAHNGFFEI
(B) opacdfklmmmmnopafklmmmmmmmmmmmmmnopaccd
(C) acbbbbaaaaaaaaccccccaaaaaaaaaaaaaaccbbb
(D) HCCCEEHHHHHHHHCCCGGGHHHHHHHHHHHHHHCCEEE

    81
(A) TKEEESYALTVASELLVRGSDLCLAPMVECVLDPTLSGS
(B) dfbccddddfklmmmpghiabdcklmmmmmmmmklmmmm
(C) bbcbbbbbbbaaaaaaccccccccaaaaaaaacaaaaac
(D) ETTTEEEEECHHHHHCTTTTTTTHHHHHHHHHCHHHHHG

    121
(A) HELKKWIYEEDLTLFGVTLGSGFWDFLDKNPEYNTSFND
(B) mmmmmmmpmklcfklmmnopafklmmmmmmmlmmmmmmm
(C) ccaaaaaacccccaaaaaacccaaaaaaaaaaaaaaaaa
(D) GHHHHHHHTTTTCHHHHHHCCCHHHHHHHCHHHHHHHHH

    161
(A) MASDSKLINLALRDCDFVFDGLESIVDVGGGTGTTAKII
(B) mmmmmmmmmmmmmmmklmgoiabdcdehklnopmmmmmm
(C) aaacaaaaaaaaaacccccccccccccccccccaaaaaa
(D) HHHHHHHHHHHHHHCGGGTTTTCEEEEETTTTTHHHHHH

    201
(A) ETFPKLKCIVFDRPQVVENLSGSNNLTYVGGDMFTSIPN
(B) mmmmbccdddddfklmgoiaceehiacddddfklpccdd
(C) aaaccbbbbbbbbccccccbbbbccbbbbbbbccccccc
(D) HHTTTTEEEEEECGGGTTTTCCBTTEEEEECBTTTBCCC

    241
(A) DAVLLKYILHNWTDKDCLRILKKCKEAVTNDGKRGKVTI
(B) bdcdehklmmpcfklmmmmmmmmmmmmmgghiacddddd
(C) cbbbbbcccccccaaaaaaaaaaaaaaaacccbbbbbbb
(D) TEEEEETTGGGCCHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTCCEEEE

    281
(A) DMVIDKKKDENQVTQIKLLMDVNMACLNGKERNEEEWKK
(B) ddddfklmcfklmmmmmmmmmmmmmnopacddfklmmmm
(C) bbbbbcccccaaaaaaaaaaaaacccccbbbbbaaaaaa
(D) EEEETTTTTCHHHHHHHHHHHHHGGGGCCCCEEHHHHHH

    321
(A) FIEAGFQHYKISPLTGFLSLIEIYP
(B) mmnopabdcdddfehjbccddddZZ
(C) aaaacccbbbbbbbbccbbbbbbbc
(D) HHHHCCCEEEEEEEETTEEEEEEEC

	


	
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7nn9

NEURAMINIDASE N9

        1
(A) RDFNNLTKGLCTINSWHIYGKDNAVRIGEDSDVLVTREP
(B) ZZcddfbccdddfbdcdfbdehlmmmmmnpccdddehia
(C) cccccccccccccccccccccccaaaaaacccbbbbbcb
(D) CCCCTTTCCBCCCCEEEEEEECCHHHHHHCTTBEEEEEE

    41
(A) VSCDPDECRFYALSQGTTIRGKHSNGTIHDRSQYRALIS
(B) dddfkbccdddddehiafklmklgoplpmbdfkbccddd
(C) bbbbccbbbbbbbbccccccccccccccccccccbbbbb
(D) EEEETTEEEEEEEEEEEETTTGGGTTTTTCCTTTTEEEE

    81
(A) PLSSPPTVYNSRVECIGWSSTSCHDGKTRMSICISGPNN
(B) ehiacdfklpccfbecjbdcdddehlaccddddeddfkl
(C) bbccccccccccccbbbcbbbbbbcccbbbbbbbbbbcc
(D) ETTTCCBTTTTEEEEECCEEEEEETTTTEEEEEEECTTT

    121
(A) ASAVIWYNRRPVTEINTWARNILRTQESECVCHNGVCPV
(B) ccdddehhiafbdcddfkopapadehpacddeehiacdd
(C) bbbbbbbccccbbbbbbccccccccccbbbbbbccbbbb
(D) TEEEEEETTEEEEEEETTTTCCCBCCCCBCCTBTTEEEE

    161
(A) FTDGSATGPAETRIYYFKEGKILKWEPLAGTAKHIEECS
(B) dedjfbbccdddddddeehiafbdcddedjbfbdchiad
(C) bbbbcccbbbbbbbbbbbcccccbbbbccccccccccbb
(D) EEECTTTTCCEEEEEEEETTEEEEEEECCCCCCCCEEEE

    201
(A) YGERAEITCTCRDNWQGSNRPVIRIDPVAMTHTSQYICS
(B) deehiacdddddfklpcbdcdddddfklopadddddfbl
(C) bbbccbbbbbbbccccccbbbbbbbcccccbbbbbbccc
(D) EEETTEEEEEEETTTTTTTTEEEEEETTTTEEEEEECCC

    241
(A) VLTDNPRPNDPTVGKCNDPYPGNNNNGVKGFSYLDGVNT
(B) dcbdcdddddfbdcfkbccehbeciadddddddehjlpc
(C) cccccccccccccccccccccccccbbbbbbbbbbcccb
(D) CCCTTTTCCCTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCEECTTTTT

    281
(A) LGRTISIASRSGYEMLKVPNALTDDKSKPTQGQTIVLNT
(B) dddfblmbcgdjdddddehklmmckbccfbdcdfbdfkb
(C) bbbbccccccbbbbbbccccccccccccccbbbbccccc
(D) EEECCTTTTTBCEEEEETTTTTTTTTTCCCEEEEEETTT

    321
(A) WSGYSGSFMDYWAEGECYRACFYVELIRGRPKEDKVWWT
(B) cddddddddfkbgcjbdcddddddddehjfklmmbccdc
(C) bbbbbbbbbcccccccbbbbbbbbbccccccccccccbb
(D) BCCCEEEEETTTTCCCCBCEEEEEEEEEETTTTTTTTCE

    361
(A) NSIVSMCSSTEFLGQWDWPDGAKIEYFL
(B) ddddddddfbdcddddddfkiafklmZZ
(C) bbbbbbbbbcccbbbbbbbccccccccc
(D) EEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCGGGGC



	


	
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De BREVERN Alexandre
Equipe de Bioinformatique Genomique & Moleculaire
E03-46 INSERM
Université Paris 7
2, place Jussieu case 7113
75251 Paris Cedex 05
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